造成女性内分泌失调的病因是比较多的，有些可以是器质性病变造成的，有些内分泌失调找不到明确的病因。例如垂体的占位病变可能会造成促性激素的分泌亢进或者减少，因此造成靶器官的分泌激素表现出异常，容易造成女性月经失调，甲状腺功能紊乱等。此外在一些靶器官部位的病变，例如卵巢囊肿，卵巢的占位病变，甲状腺结节等都会影响女性的内分泌，造成内分泌功能失调。也有一些内分泌失调经过检查后没有明确的器质性病变，可能和特定的生理阶段有关，例如妊娠期，更年期等，考虑和植物神经功能紊乱，体内激素水平的改变等相关。