病人发现胃肠道间质瘤后，首先要确定肿瘤生长的部位和大小，病理的恶性程度和当地的医疗水平情况。在比较大的医院或医疗中心发现了小于三厘米的胃间质瘤，首选的方法是进行胃镜下肿瘤剥离术，在小一点的医院也可以进行手术切除的治疗，如果医院不能精通相应的治疗，建议病人到较大的医院治疗。