宝宝如果拉肚子是可以长时间吃益生菌的。宝宝如果因胃部消化不良，急慢性腹泻或者是大便干燥造成的营养不良，家长是可以给孩子适当的补充益生菌的。但宝宝在服用益生菌时，需要注意以下几个方面，第一，在冲益生菌时不可用高于45摄氏度的水进行冲。第二，如果宝宝已经吃了抗生素，便不可服用益生菌，如果是家长必须要服用益生菌，应该两种药物时间间隔至少三个小时。第三，益生菌不应长时间的暴露在空气之中，家长应该在使用之前再打开益生菌的包装。